Подсистема OS/2 поддерживает символьные приложения OS/2 1.х на процессорах х86. Приложения, разработанные для OS/2 или MS DOS, всегда будут работать в среде OS/2, если эта подсистема доступна.
Windows NT 4.0 не поддерживает высокопроизводительную файловую систему HPFS, разработанную специально для OS/2 1.х. Начиная с версии 4.0, Windows NT больше не будет поддерживать эту файловую систему.